| 1e Ronde | 25.09.2003 | Girondins Bordeaux | - | FK Artmedia Petržalka | 2:1 |  |
|||
| 1e Ronde | 15.10.2003 | FK Artmedia Petržalka | - | Girondins Bordeaux | 1:1 | ||||
| 2e Ronde | 06.11.2003 | Girondins Bordeaux | - | Heart of Midlothian | 0:1 | ||||
| 2e Ronde | 27.11.2003 | Heart of Midlothian | - | Girondins Bordeaux | 0:2 | |
|||
| 3e Ronde | 26.02.2004 | Groclin Dyskobolia | - | Girondins Bordeaux | 0:1 | ||||
| 3e Ronde | 03.03.2004 | Girondins Bordeaux | - | Groclin Dyskobolia | 4:1 | |
|||
| Achtste finale | 11.03.2004 | Girondins Bordeaux | - | Club Brugge KV | 3:1 | |
|||
| Achtste finale | 25.03.2004 | Club Brugge KV | - | Girondins Bordeaux | 0:1 | ||||
| Kwartfinale | 08.04.2004 | Girondins Bordeaux | - | Valencia CF | 1:2 | |
 |
||
| Kwartfinale | 14.04.2004 | Valencia CF | - | Girondins Bordeaux | 2:1 | |
Spanje