| 4. Ronde | 20.03.2012 | FC Levadia | - | FC Flora | 1:1 |  |
|||
| 3. Ronde | 24.03.2012 | FC Flora | - | JK Tammeka | 4:0 | |
|||
| 6. Ronde | 07.04.2012 | JK Tallinna Kalev | - | FC Flora | 0:3 | |
|||
| 17. Ronde | 26.06.2012 | FC Flora | - | FC Viljandi | 5:0 | |
|||
| 30. Ronde | 22.09.2012 | JK Tammeka | - | FC Flora | 0:3 | |
|||
| 33. Ronde | 06.10.2012 | FC Flora | - | JK Tallinna Kalev | 3:1 | |
|||
| 34. Ronde | 20.10.2012 | Paide Linnameeskond | - | FC Flora | 0:6 | |
|||
| 36. Ronde | 03.11.2012 | JK Narva Trans | - | FC Flora | 2:2 | |
Estland