| 1. Ronde | 29.07.2006 | NK Međimurje | - | Hajduk Split | 0:2 | ||||
| 2. Ronde | 05.08.2006 | NK Varteks | - | NK Međimurje | 3:1 |  |
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| 5. Ronde | 26.08.2006 | NK Međimurje | - | HNK Šibenik | 2:1 | ||||
| 9. Ronde | 30.09.2006 | Kamen Ingrad | - | NK Međimurje | 0:2 |  |
|||
| 10. Ronde | 14.10.2006 | NK Međimurje | - | NK Zagreb | 2:0 | ||||
| 13. Ronde | 04.11.2006 | NK Međimurje | - | NK Varteks | 5:1 | ||||
| 14. Ronde | 08.11.2006 | NK Osijek | - | NK Međimurje | 1:1 | ||||
| 16. Ronde | 18.11.2006 | HNK Šibenik | - | NK Međimurje | 3:0 | ||||
| 17. Ronde | 25.11.2006 | NK Međimurje | - | NK Pula 1856 | 1:0 | ||||
| 18. Ronde | 02.12.2006 | Slaven Belupo | - | NK Međimurje | 1:0 | ||||
| 15. Ronde | 09.12.2006 | NK Međimurje | - | Dinamo Zagreb | 2:3 | ||||
| 19. Ronde | 17.02.2007 | HNK Cibalia | - | NK Međimurje | 0:3 | ||||
| 20. Ronde | 24.02.2007 | NK Međimurje | - | Kamen Ingrad | 2:0 | ||||
| 22. Ronde | 10.03.2007 | NK Međimurje | - | HNK Rijeka | 1:2 | ||||
| 26. Ronde | 14.04.2007 | NK Međimurje | - | HNK Šibenik | 0:1 | ||||
| 29. Ronde | 28.04.2007 | Dinamo Zagreb | - | NK Međimurje | 4:1 | ||||
| 30. Ronde | 02.05.2007 | NK Međimurje | - | NK Varteks | 1:2 | ||||
| 31. Ronde | 05.05.2007 | NK Osijek | - | NK Međimurje | 6:1 | ||||
| 32. Ronde | 12.05.2007 | NK Međimurje | - | NK Pula 1856 | 1:0 |
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