| 20. Ronde | 06.01.2013 | Real Murcia | - | Hércules CF | 2:1 | ||||
| 21. Ronde | 13.01.2013 | Hércules CF | - | Racing Santander | 2:0 |  |
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| 22. Ronde | 20.01.2013 | Hércules CF | - | CD Lugo | 3:0 | ||||
| 23. Ronde | 26.01.2013 | Elche CF | - | Hércules CF | 2:0 | ||||
| 24. Ronde | 02.02.2013 | Hércules CF | - | AD Alcorcón | 3:0 | ||||
| 28. Ronde | 03.03.2013 | Hércules CF | - | UD Almería | 0:2 | ||||
| 29. Ronde | 11.03.2013 | Real Madrid Castilla | - | Hércules CF | 1:1 | |
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| 30. Ronde | 17.03.2013 | Hércules CF | - | CE Sabadell | 3:1 | ||||
| 31. Ronde | 24.03.2013 | CD Guadalajara | - | Hércules CF | 0:2 | |
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| 32. Ronde | 31.03.2013 | Hércules CF | - | SD Ponferradina | 1:1 | ||||
| 33. Ronde | 07.04.2013 | Xerez CD | - | Hércules CF | 0:0 | ||||
| 34. Ronde | 13.04.2013 | UD Las Palmas | - | Hércules CF | 0:0 | ||||
| 35. Ronde | 21.04.2013 | Hércules CF | - | Córdoba CF | 1:0 | ||||
| 36. Ronde | 27.04.2013 | Sporting Gijón | - | Hércules CF | 0:1 | ||||
| 37. Ronde | 05.05.2013 | Hércules CF | - | SD Huesca | 2:1 | |
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| 38. Ronde | 13.05.2013 | Recreativo Huelva | - | Hércules CF | 0:2 | ||||
| 39. Ronde | 19.05.2013 | Hércules CF | - | CD Mirandés | 1:0 | ||||
| 40. Ronde | 26.05.2013 | CD Numancia | - | Hércules CF | 3:2 | ||||
| 41. Ronde | 02.06.2013 | Hércules CF | - | Real Murcia | 0:2 | |
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