| 2. Ronde | 10.07.2016 | Atlético Junior | - | Independiente Medellín | 1:1 | ||||
| 4. Ronde | 18.07.2016 | Atlético Junior | - | Santa Fe | 2:1 | ||||
| 10. Ronde | 29.08.2016 | Atlético Junior | - | Jaguares de Córdoba | 1:0 | ||||
| 7. Ronde | 04.09.2016 | Jaguares de Córdoba | - | Atlético Junior | 0:0 | ||||
| 1. Ronde | 08.09.2016 | Atlético Huila | - | Atlético Junior | 3:1 |  |
|||
| 13. Ronde | 18.09.2016 | Atlético Junior | - | Once Caldas | 0:1 | |
|||
| 3. Ronde | 08.10.2016 | Patriotas FC | - | Atlético Junior | 3:2 | ||||
| 18. Ronde | 30.10.2016 | Atlético Junior | - | Envigado FC | 2:1 | ||||
| 15. Ronde | 04.11.2016 | Atlético Junior | - | Millonarios | 2:1 | ||||
| 19. Ronde | 06.11.2016 | Cortuluá | - | Atlético Junior | 1:2 | ||||
| 12. Ronde | 10.11.2016 | Atlético Nacional | - | Atlético Junior | 2:2 |  |
Colombia