| 17. Ronde | 14.07.2016 | FK Trakai | - | FC Stumbras | 0:2 | ||||
| 18. Ronde | 20.07.2016 | FK Sūduva | - | FK Trakai | 1:0 | ||||
| 19. Ronde | 28.07.2016 | FK Trakai | - | Utenis Utena | 4:3 | ||||
| 20. Ronde | 03.08.2016 | FK Jonava | - | FK Trakai | 1:1 |  |
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| 23. Ronde | 25.08.2016 | FK Trakai | - | Kauno Žalgiris | 3:0 |  |
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| 25. Ronde | 14.09.2016 | FK Trakai | - | FK Sūduva | 2:0 | |
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| 26. Ronde | 19.09.2016 | Utenis Utena | - | FK Trakai | 0:1 |
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