| 1. Ronde | 29.07.2006 | FC Gueugnon | - | FC Metz | 0:1 | ||||
| 2. Ronde | 04.08.2006 | Montpellier HSC | - | FC Gueugnon | 0:3 |  |
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| 3. Ronde | 08.08.2006 | FC Gueugnon | - | Chamois Niortais | 0:1 | ||||
| 4. Ronde | 11.08.2006 | US Créteil-Lusitanos | - | FC Gueugnon | 0:0 | ||||
| 6. Ronde | 25.08.2006 | EA Guingamp | - | FC Gueugnon | 6:1 | |
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| 7. Ronde | 08.09.2006 | FC Gueugnon | - | Tours FC | 2:1 | ||||
| 8. Ronde | 15.09.2006 | LB Châteauroux | - | FC Gueugnon | 2:1 | ||||
| 9. Ronde | 22.09.2006 | FC Gueugnon | - | Dijon FCO | 0:2 | ||||
| 11. Ronde | 13.10.2006 | FC Gueugnon | - | AC Ajaccio | 1:0 | ||||
| 12. Ronde | 20.10.2006 | Grenoble Foot 38 | - | FC Gueugnon | 2:2 | ||||
| 13. Ronde | 27.10.2006 | FC Gueugnon | - | RC Strasbourg | 0:1 | ||||
| 14. Ronde | 03.11.2006 | FC Gueugnon | - | Stade de Reims | 0:0 | ||||
| 16. Ronde | 10.11.2006 | FC Gueugnon | - | SM Caen | 0:1 | ||||
| 17. Ronde | 17.11.2006 | FC Libourne-Saint-Seurin | - | FC Gueugnon | 2:1 |
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