| 22. Ronde | 15.01.2000 | Atlético Madrid B | - | CF Extremadura | 4:2 | ||||
| 23. Ronde | 22.01.2000 | CD Leganés | - | Atlético Madrid B | 0:1 | ||||
| 24. Ronde | 30.01.2000 | Atlético Madrid B | - | CA Osasuna | 1:1 |  |
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| 25. Ronde | 06.02.2000 | SD Compostela | - | Atlético Madrid B | 1:1 |  |
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| 27. Ronde | 19.02.2000 | UD Las Palmas | - | Atlético Madrid B | 1:1 | |
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| 28. Ronde | 27.02.2000 | Atlético Madrid B | - | CD Logroñés | 0:1 | ||||
| 29. Ronde | 05.03.2000 | UE Lleida | - | Atlético Madrid B | 3:0 | ||||
| 30. Ronde | 11.03.2000 | Atlético Madrid B | - | UD Salamanca | 2:1 | |
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| 31. Ronde | 19.03.2000 | Albacete | - | Atlético Madrid B | 1:0 | ||||
| 32. Ronde | 26.03.2000 | Atlético Madrid B | - | CD Badajoz | 0:0 | ||||
| 34. Ronde | 09.04.2000 | Atlético Madrid B | - | SD Eibar | 2:0 | |
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| 42. Ronde | 04.06.2000 | Atlético Madrid B | - | CP Mérida | 0:0 |
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