| 15. Ronde | 16.01.1999 | Apollon Smyrnis | - | Ethnikos Piraeus | 4:0 | ||||
| 17. Ronde | 30.01.1999 | Veria FC | - | Ethnikos Piraeus | 4:3 | ||||
| 23. Ronde | 14.03.1999 | Ethnikos Piraeus | - | Ionikos Nikea | 1:2 |  |
|||
| 24. Ronde | 21.03.1999 | Aris Saloniki | - | Ethnikos Piraeus | 4:0 | ||||
| 25. Ronde | 28.03.1999 | Ethnikos Piraeus | - | AO Kavala | 0:2 |  |
|||
| 26. Ronde | 19.04.1999 | Panathinaikos | - | Ethnikos Piraeus | 5:1 | ||||
| 28. Ronde | 02.05.1999 | Ethnikos Piraeus | - | Iraklis Saloniki | 1:2 | |
|
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| 29. Ronde | 09.05.1999 | Skoda Xanthi | - | Ethnikos Piraeus | 2:0 | ||||
| 30. Ronde | 12.05.1999 | Ethnikos Piraeus | - | Olympiakos | 0:3 | ||||
| 31. Ronde | 16.05.1999 | AEK Athene | - | Ethnikos Piraeus | 2:0 | ||||
| 32. Ronde | 20.05.1999 | Ethnikos Piraeus | - | Apollon Smyrnis | 2:3 | ||||
| 33. Ronde | 23.05.1999 | Panelefsiniakos Elefsinas | - | Ethnikos Piraeus | 3:0 | ||||
| 34. Ronde | 30.05.1999 | Ethnikos Piraeus | - | Veria FC | 0:2 |
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