| 22. Ronde | 13.01.2006 | Clermont Foot Auvergne | - | FC Gueugnon | 0:1 | ||||
| 23. Ronde | 20.01.2006 | FC Gueugnon | - | Stade de Reims | 0:0 | ||||
| 24. Ronde | 03.02.2006 | Amiens SC | - | FC Gueugnon | 0:0 | ||||
| 25. Ronde | 10.02.2006 | FC Gueugnon | - | EA Guingamp | 1:0 |  |
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| 26. Ronde | 17.02.2006 | FC Sète | - | FC Gueugnon | 2:0 | ||||
| 28. Ronde | 03.03.2006 | Stade Lavallois | - | FC Gueugnon | 1:1 | ||||
| 29. Ronde | 10.03.2006 | FC Gueugnon | - | FC Istres | 2:0 | |
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| 30. Ronde | 17.03.2006 | Dijon FCO | - | FC Gueugnon | 3:0 | ||||
| 31. Ronde | 24.03.2006 | FC Gueugnon | - | Grenoble Foot 38 | 1:1 | ||||
| 33. Ronde | 07.04.2006 | FC Gueugnon | - | FC Lorient | 0:1 | ||||
| 34. Ronde | 14.04.2006 | FC Gueugnon | - | SC Bastia | 2:0 | ||||
| 36. Ronde | 28.04.2006 | FC Gueugnon | - | Montpellier HSC | 3:1 | ||||
| 38. Ronde | 12.05.2006 | FC Gueugnon | - | Stade Brestois 29 | 0:1 |
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