| 6. Ronde | 22.08.2008 | FC Artmedia Petržalka | - | MFK Košice | 2:3 |  |
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| 11. Ronde | 04.10.2008 | MFK Košice | - | 1. FC Tatran Prešov | 5:5 | |
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| 14. Ronde | 01.11.2008 | MFK Dubnica | - | MFK Košice | 3:1 | |
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| 16. Ronde | 15.11.2008 | Zlaté Moravce | - | MFK Košice | 2:2 | |
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| 22. Ronde | 22.03.2009 | 1. FC Tatran Prešov | - | MFK Košice | 1:2 | |
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| 27. Ronde | 02.05.2009 | MFK Košice | - | Zlaté Moravce | 2:0 | |
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| 29. Ronde | 13.05.2009 | MFK Košice | - | MŠK Žilina | 3:0 | |
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| 32. Ronde | 26.05.2009 | Slovan Bratislava | - | MFK Košice | 1:2 | |
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