| 14. Ronde | 19.05.2021 | FCI Levadia | - | FC Flora | 2:4 | ||||
| 15. Ronde | 26.05.2021 | JK Narva Trans | - | FC Flora | 0:2 | ||||
| 16. Ronde | 29.05.2021 | FC Flora | - | Tulevik Viljandi | 3:0 |  |
|||
| 1. Ronde | 13.06.2021 | FC Flora | - | Pärnu JK Vaprus | 2:0 | ||||
| 3. Ronde | 21.06.2021 | JK Tammeka | - | FC Flora | 0:3 | ||||
| 2. Ronde | 25.06.2021 | FC Flora | - | JK Nõmme Kalju | 1:0 | |
|||
| 18. Ronde | 30.06.2021 | FC Flora | - | Paide Linnameeskond | 3:3 |  |
|||
| 5. Ronde | 31.07.2021 | Paide Linnameeskond | - | FC Flora | 0:0 | ||||
| 22. Ronde | 29.08.2021 | FC Flora | - | Tallinna JK Legion | 5:1 | ||||
| 23. Ronde | 12.09.2021 | Pärnu JK Vaprus | - | FC Flora | 0:6 | |
|||
| 24. Ronde | 19.09.2021 | FC Flora | - | JK Nõmme Kalju | 2:0 | ||||
| 19. Ronde | 22.09.2021 | FC Flora | - | JK Narva Trans | 5:2 | ||||
| 25. Ronde | 26.09.2021 | Tulevik Viljandi | - | FC Flora | 2:2 | ||||
| 26. Ronde | 03.10.2021 | FC Flora | - | JK Tammeka | 3:0 | ||||
| 27. Ronde | 17.10.2021 | Paide Linnameeskond | - | FC Flora | 1:1 | |
|||
| 13. Ronde | 27.10.2021 | FC Flora | - | JK Tammeka | 9:0 | ||||
| 21. Ronde | 01.12.2021 | FCI Levadia | - | FC Flora | 1:5 |
Estland