| 1. Ronde | 15.02.2009 | Cienciano | - | FBC Melgar | 2:1 | ||||
| 2. Ronde | 22.02.2009 | José Gálvez | - | Cienciano | 1:1 |  |
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| 3. Ronde | 01.03.2009 | Cienciano | - | Universitario de Deportes | 1:1 | ||||
| 4. Ronde | 08.03.2009 | Sporting Cristal | - | Cienciano | 0:2 | ||||
| 5. Ronde | 15.03.2009 | Cienciano | - | Universidad Cesar Vallejo | 1:1 | ||||
| 6. Ronde | 22.03.2009 | Sport Huancayo | - | Cienciano | 2:0 | ||||
| 7. Ronde | 05.04.2009 | Cienciano | - | Sport Áncash | 0:0 | |
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| 8. Ronde | 12.04.2009 | Alianza Lima | - | Cienciano | 2:0 | |
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| 9. Ronde | 19.04.2009 | Cienciano | - | Coronel Bolognesi | 0:0 | |
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| 18. Ronde | 21.06.2009 | Universitario de Deportes | - | Cienciano | 2:1 | |
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| 23. Ronde | 26.07.2009 | Cienciano | - | Alianza Lima | 0:2 | ||||
| 24. Ronde | 30.07.2009 | Coronel Bolognesi | - | Cienciano | 0:0 | ||||
| 27. Ronde | 16.08.2009 | Cienciano | - | CN Iquitos | 2:1 |  |
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