| 9. Ronde | 28.09.2008 | Hajduk Split | - | NK Inter Zaprešić | 3:3 | ||||
| 10. Ronde | 05.10.2008 | NK Inter Zaprešić | - | Slaven Belupo | 0:0 | ||||
| 11. Ronde | 19.10.2008 | NK Osijek | - | NK Inter Zaprešić | 2:1 | ||||
| 12. Ronde | 26.10.2008 | HNK Šibenik | - | NK Inter Zaprešić | 1:1 | ||||
| 13. Ronde | 02.11.2008 | NK Inter Zaprešić | - | Dinamo Zagreb | 1:3 | ||||
| 16. Ronde | 23.11.2008 | NK Inter Zaprešić | - | HNK Cibalia | 1:2 |  |
|||
| 23. Ronde | 22.03.2009 | HNK Šibenik | - | NK Inter Zaprešić | 4:0 | ||||
| 24. Ronde | 05.04.2009 | NK Inter Zaprešić | - | Slaven Belupo | 1:0 | ||||
| 25. Ronde | 11.04.2009 | Dinamo Zagreb | - | NK Inter Zaprešić | 1:0 | |
|||
| 26. Ronde | 19.04.2009 | NK Inter Zaprešić | - | Hajduk Split | 0:2 | ||||
| 27. Ronde | 22.04.2009 | NK Osijek | - | NK Inter Zaprešić | 1:1 | ||||
| 28. Ronde | 26.04.2009 | NK Inter Zaprešić | - | HNK Cibalia | 0:0 | ||||
| 29. Ronde | 03.05.2009 | NK Zagreb | - | NK Inter Zaprešić | 1:0 | |
|||
| 31. Ronde | 17.05.2009 | NK Inter Zaprešić | - | NK Zadar | 2:2 | ||||
| 32. Ronde | 24.05.2009 | NK Varteks | - | NK Inter Zaprešić | 0:1 | ||||
| 33. Ronde | 31.05.2009 | NK Inter Zaprešić | - | HNK Rijeka | 3:0 |
Kroatië