| 1. Ronde | 18.03.2021 | Chacaritas FC | - | Independiente Juniors | 1:4 | ||||
| 13. Ronde | 09.06.2021 | Gualaceo SC | - | Independiente Juniors | 0:0 | ||||
| 14. Ronde | 13.06.2021 | Independiente Juniors | - | El Nacional | 1:3 | ||||
| 15. Ronde | 16.06.2021 | América de Quito | - | Independiente Juniors | 1:1 | ||||
| 16. Ronde | 21.06.2021 | Independiente Juniors | - | Atlético Porteño | 3:0 |  |
|||
| 17. Ronde | 24.06.2021 | Cumbayá | - | Independiente Juniors | 2:0 | ||||
| 18. Ronde | 27.06.2021 | Independiente Juniors | - | Chacaritas FC | 3:2 | ||||
| 19. Ronde | 04.07.2021 | El Nacional | - | Independiente Juniors | 1:0 | ||||
| 20. Ronde | 09.07.2021 | Independiente Juniors | - | Gualaceo SC | 1:3 | ||||
| 22. Ronde | 16.07.2021 | Independiente Juniors | - | Guayaquil SC | 1:2 | ||||
| 23. Ronde | 18.07.2021 | Independiente Juniors | - | Liga de Portoviejo | 3:1 | ||||
| 24. Ronde | 22.07.2021 | Chacaritas FC | - | Independiente Juniors | 0:0 | ||||
| 27. Ronde | 10.08.2021 | Independiente Juniors | - | América de Quito | 1:2 | ||||
| 33. Ronde | 24.09.2021 | Cumbayá | - | Independiente Juniors | 2:1 | ||||
| 36. Ronde | 13.10.2021 | Independiente Juniors | - | El Nacional | 1:1 |
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