| 8. Ronde | 17.08.2016 | Fakel Voronezh | - | FK Khimki | 2:0 | ||||
| 13. Ronde | 12.10.2016 | FK Khimki | - | Dinamo Moskou | 0:0 | ||||
| 17. Ronde | 15.10.2016 | FK Khimki | - | Spartak Nalchik | 2:0 | ||||
| 18. Ronde | 22.10.2016 | Luch-Energiya Vladivostok | - | FK Khimki | 2:0 | ||||
| 19. Ronde | 30.10.2016 | FK Khimki | - | Spartak Moskou 2 | 1:0 | ||||
| 20. Ronde | 05.11.2016 | FK Tambov | - | FK Khimki | 0:1 | ||||
| 21. Ronde | 09.11.2016 | FK Khimki | - | SKA-Khabarovsk | 0:0 | ||||
| 22. Ronde | 13.11.2016 | FK Khimki | - | FK Neftekhimik | 3:2 | ||||
| 23. Ronde | 19.11.2016 | Sibir Novosibirsk | - | FK Khimki | 1:0 | ||||
| 24. Ronde | 26.11.2016 | FK Khimki | - | Mordovia Saransk | 4:3 | ||||
| 25. Ronde | 08.03.2017 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | FK Khimki | 2:1 |  |
 |
||
| 26. Ronde | 12.03.2017 | FK Khimki | - | Fakel Voronezh | 0:0 | ||||
| 28. Ronde | 26.03.2017 | FK Khimki | - | Shinnik Yaroslavl | 3:0 | ||||
| 29. Ronde | 01.04.2017 | FK Tyumen | - | FK Khimki | 1:1 | ||||
| 37. Ronde | 14.05.2017 | Spartak Moskou 2 | - | FK Khimki | 4:0 | ||||
| 27. Ronde | 17.05.2017 | Sokol Saratov | - | FK Khimki | 1:0 | ||||
| 38. Ronde | 20.05.2017 | FK Khimki | - | FK Tosno | 1:3 |
Rusland