| 2. Ronde | 06.03.1999 | Etoile Carouge FC | - | FC Wil 1900 | 1:3 | ||||
| 4. Ronde | 21.03.1999 | FC Aarau | - | FC Wil 1900 | 3:1 | ||||
| 8. Ronde | 25.04.1999 | Yverdon Sport FC | - | FC Wil 1900 | 3:4 | ||||
| 9. Ronde | 02.05.1999 | FC Wil 1900 | - | FC Lugano | 3:0 | ||||
| 10. Ronde | 08.05.1999 | FC Sion | - | FC Wil 1900 | 2:0 | ||||
| 14. Ronde | 05.06.1999 | BSC Young Boys | - | FC Wil 1900 | 3:2 |
Spanje