| 4. Ronde | 15.08.2009 | FC Schaffhausen | - | FC Wil 1900 | 3:2 | ||||
| 5. Ronde | 22.08.2009 | FC Schaffhausen | - | FC Lugano | 0:5 | ||||
| 6. Ronde | 30.08.2009 | FC Gossau | - | FC Schaffhausen | 1:1 | ||||
| 7. Ronde | 12.09.2009 | FC Schaffhausen | - | FC Vaduz | 1:1 | ||||
| 8. Ronde | 23.09.2009 | FC Thun | - | FC Schaffhausen | 1:0 | ||||
| 9. Ronde | 26.09.2009 | FC Lausanne-Sport | - | FC Schaffhausen | 1:0 | ||||
| 10. Ronde | 03.10.2009 | FC Schaffhausen | - | Servette FC | 2:2 | ||||
| 11. Ronde | 24.10.2009 | FC Wohlen | - | FC Schaffhausen | 2:4 | ||||
| 12. Ronde | 01.11.2009 | FC Locarno | - | FC Schaffhausen | 2:2 | ||||
| 13. Ronde | 07.11.2009 | Yverdon Sport FC | - | FC Schaffhausen | 1:1 | ||||
| 14. Ronde | 29.11.2009 | FC Schaffhausen | - | FC Biel/Bienne | 3:2 | ||||
| 15. Ronde | 06.12.2009 | FC Stade Nyonnais | - | FC Schaffhausen | 2:3 | ||||
| 17. Ronde | 22.02.2010 | FC Schaffhausen | - | FC Locarno | 3:1 | ||||
| 18. Ronde | 28.02.2010 | FC Schaffhausen | - | FC Lausanne-Sport | 1:0 | ||||
| 19. Ronde | 06.03.2010 | Servette FC | - | FC Schaffhausen | 4:0 | ||||
| 20. Ronde | 14.03.2010 | FC Lugano | - | FC Schaffhausen | 4:2 |  |
|||
| 29. Ronde | 08.05.2010 | FC Schaffhausen | - | SC Kriens | 1:2 | ||||
| 30. Ronde | 15.05.2010 | FC Schaffhausen | - | FC Stade Nyonnais | 1:3 |
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