| 1. Ronde | 24.07.2016 | Næstved BK | - | Nykøbing FC | 0:1 |  |
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| 2. Ronde | 31.07.2016 | Nykøbing FC | - | Vendsyssel FF | 3:2 | |
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| 5. Ronde | 21.08.2016 | AB Gladsaxe | - | Nykøbing FC | 1:2 | |
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| 6. Ronde | 28.08.2016 | FC Fredericia | - | Nykøbing FC | 1:2 | |
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| 13. Ronde | 16.10.2016 | Nykøbing FC | - | AB Gladsaxe | 2:3 | |
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| 16. Ronde | 06.11.2016 | Hobro IK | - | Nykøbing FC | 0:1 | |
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| 19. Ronde | 27.11.2016 | FC Fredericia | - | Nykøbing FC | 0:2 | |
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| 17. Ronde | 01.12.2016 | Nykøbing FC | - | Vejle BK | 4:3 | |
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| 27. Ronde | 23.04.2017 | Nykøbing FC | - | FC Fredericia | 2:2 | |
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| 32. Ronde | 21.05.2017 | Skive IK | - | Nykøbing FC | 2:3 | |
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| 33. Ronde | 27.05.2017 | Nykøbing FC | - | Fremad Amager | 2:0 | |
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