| 9. Ronde | 17.09.2016 | NK Krško | - | NK Maribor | 1:2 |  |
|||
| 10. Ronde | 21.09.2016 | NK Krško | - | Rudar Velenje | 1:0 | ||||
| 12. Ronde | 02.10.2016 | NK Krško | - | Olimpija Ljubljana | 1:2 | ||||
| 13. Ronde | 14.10.2016 | ND Gorica | - | NK Krško | 1:1 | ||||
| 14. Ronde | 22.10.2016 | NK Krško | - | NK Aluminij | 2:2 | ||||
| 15. Ronde | 29.10.2016 | NK Celje | - | NK Krško | 0:3 | ||||
| 16. Ronde | 06.11.2016 | NK Krško | - | NK Radomlje | 1:1 | ||||
| 17. Ronde | 19.11.2016 | NK Krško | - | FC Koper | 0:0 | ||||
| 18. Ronde | 26.11.2016 | NK Maribor | - | NK Krško | 4:0 | ||||
| 19. Ronde | 30.11.2016 | Rudar Velenje | - | NK Krško | 2:2 | |
|||
| 20. Ronde | 04.12.2016 | NK Krško | - | NK Domžale | 0:0 | ||||
| 22. Ronde | 26.02.2017 | NK Krško | - | ND Gorica | 1:2 | |
|||
| 23. Ronde | 05.03.2017 | NK Aluminij | - | NK Krško | 1:1 | |
|||
| 31. Ronde | 29.04.2017 | ND Gorica | - | NK Krško | 0:0 | ||||
| 32. Ronde | 05.05.2017 | NK Krško | - | NK Aluminij | 1:1 | ||||
| 33. Ronde | 12.05.2017 | NK Celje | - | NK Krško | 1:2 | ||||
| 34. Ronde | 16.05.2017 | NK Krško | - | NK Radomlje | 2:0 | ||||
| 35. Ronde | 21.05.2017 | NK Krško | - | FC Koper | 1:1 | ||||
| 36. Ronde | 27.05.2017 | NK Maribor | - | NK Krško | 1:0 |
Slovenië