| 10. Ronde | 27.09.2008 | FC Nitra | - | FK Dukla Banská Bystrica | 1:2 |  |
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| 14. Ronde | 01.11.2008 | FC Artmedia Petržalka | - | FC Nitra | 1:1 | |
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| 16. Ronde | 15.11.2008 | 1. FC Tatran Prešov | - | FC Nitra | 1:1 | |
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| 21. Ronde | 14.03.2009 | FK Dukla Banská Bystrica | - | FC Nitra | 2:1 | |
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| 22. Ronde | 22.03.2009 | FC Nitra | - | MFK Dubnica | 2:1 | |
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| 30. Ronde | 16.05.2009 | FC Nitra | - | MFK Košice | 4:1 | |
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| 32. Ronde | 26.05.2009 | FC Nitra | - | FK Dukla Banská Bystrica | 2:1 | |
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| 33. Ronde | 30.05.2009 | MFK Dubnica | - | FC Nitra | 4:1 | |
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