| 3. Ronde | 13.09.2008 | Rayo Vallecano | - | Deportivo Alavés | 2:1 | ||||
| 4. Ronde | 20.09.2008 | Sevilla Atlético | - | Rayo Vallecano | 0:0 | ||||
| 7. Ronde | 12.10.2008 | Rayo Vallecano | - | CD Castellón | 4:2 |  |
|||
| 8. Ronde | 19.10.2008 | Gimnàstic de Tarragona | - | Rayo Vallecano | 3:1 | ||||
| 9. Ronde | 25.10.2008 | Rayo Vallecano | - | SD Eibar | 4:1 | ||||
| 10. Ronde | 02.11.2008 | CD Tenerife | - | Rayo Vallecano | 2:0 | ||||
| 12. Ronde | 16.11.2008 | Celta de Vigo | - | Rayo Vallecano | 0:0 | ||||
| 14. Ronde | 29.11.2008 | Albacete | - | Rayo Vallecano | 2:1 | ||||
| 15. Ronde | 06.12.2008 | Rayo Vallecano | - | UD Salamanca | 1:1 | ||||
| 17. Ronde | 20.12.2008 | Elche CF | - | Rayo Vallecano | 2:0 | ||||
| 18. Ronde | 04.01.2009 | Rayo Vallecano | - | Levante UD | 0:0 | ||||
| 27. Ronde | 07.03.2009 | Rayo Vallecano | - | Girona FC | 1:1 | ||||
| 33. Ronde | 18.04.2009 | Rayo Vallecano | - | Celta de Vigo | 4:1 | ||||
| 37. Ronde | 16.05.2009 | Rayo Vallecano | - | Córdoba CF | 5:0 | |
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| 41. Ronde | 13.06.2009 | UD Las Palmas | - | Rayo Vallecano | 0:0 |
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