| 16. Ronde | 15.11.2008 | Fortuna Sittard | - | FC Zwolle | 1:3 | ||||
| 17. Ronde | 21.11.2008 | FC Omniworld | - | FC Zwolle | 3:3 | ||||
| 27. Ronde | 20.02.2009 | FC Emmen | - | FC Zwolle | 1:0 | ||||
| 28. Ronde | 27.02.2009 | FC Zwolle | - | BV Veendam | 3:2 | ||||
| 29. Ronde | 06.03.2009 | RKC Waalwijk | - | FC Zwolle | 1:0 | ||||
| 30. Ronde | 13.03.2009 | FC Zwolle | - | FC Omniworld | 3:1 | ||||
| 31. Ronde | 20.03.2009 | SBV Excelsior | - | FC Zwolle | 0:2 | ||||
| 32. Ronde | 27.03.2009 | FC Zwolle | - | FC Den Bosch | 1:0 | ||||
| 34. Ronde | 10.04.2009 | FC Zwolle | - | TOP Oss | 0:0 |  |
|||
| 35. Ronde | 17.04.2009 | FC Zwolle | - | Fortuna Sittard | 2:1 | ||||
| 36. Ronde | 24.04.2009 | FC Eindhoven | - | FC Zwolle | 2:0 | ||||
| 37. Ronde | 01.05.2009 | Helmond Sport | - | FC Zwolle | 0:0 | ||||
| 38. Ronde | 08.05.2009 | FC Zwolle | - | HFC Haarlem | 3:2 |
Nederland