| 1e Ronde | 15.09.2005 | FC Basel 1893 | - | Široki Brijeg | 5:0 | ||||
| 1e Ronde | 29.09.2005 | Široki Brijeg | - | FC Basel 1893 | 0:1 | ||||
| Groep E | 20.10.2005 | FC Basel 1893 | - | RC Strasbourg | 0:2 |  |
|||
| Groep E | 03.11.2005 | Rode Ster Belgrado | - | FC Basel 1893 | 1:2 | ||||
| Groep E | 01.12.2005 | FC Basel 1893 | - | Tromsø IL | 4:3 |  |
|||
| Groep E | 14.12.2005 | AS Roma | - | FC Basel 1893 | 3:1 | ||||
| Achtste finale | 16.03.2006 | RC Strasbourg | - | FC Basel 1893 | 2:2 | ||||
| Kwartfinale | 30.03.2006 | FC Basel 1893 | - | Middlesbrough FC | 2:0 | ||||
| Kwartfinale | 06.04.2006 | Middlesbrough FC | - | FC Basel 1893 | 4:1 |
Australië
Zwitserland