| 1. Ronde | 19.08.2012 | AD Alcorcón | - | CD Guadalajara | 1:1 | ||||
| 2. Ronde | 25.08.2012 | CD Guadalajara | - | Girona FC | 1:5 | ||||
| 3. Ronde | 01.09.2012 | Villarreal CF | - | CD Guadalajara | 2:1 | ||||
| 6. Ronde | 22.09.2012 | CD Guadalajara | - | Real Madrid Castilla | 3:4 |  |
|||
| 7. Ronde | 29.09.2012 | CE Sabadell | - | CD Guadalajara | 2:1 | ||||
| 8. Ronde | 06.10.2012 | CD Guadalajara | - | Xerez CD | 1:1 | ||||
| 9. Ronde | 13.10.2012 | CD Guadalajara | - | SD Ponferradina | 2:0 | ||||
| 10. Ronde | 20.10.2012 | Hércules CF | - | CD Guadalajara | 0:0 | ||||
| 11. Ronde | 27.10.2012 | CD Guadalajara | - | UD Las Palmas | 2:3 | ||||
| 12. Ronde | 04.11.2012 | Córdoba CF | - | CD Guadalajara | 1:0 | |
|||
| 13. Ronde | 10.11.2012 | CD Guadalajara | - | Sporting Gijón | 2:1 | ||||
| 14. Ronde | 18.11.2012 | SD Huesca | - | CD Guadalajara | 2:1 | ||||
| 15. Ronde | 24.11.2012 | CD Guadalajara | - | Recreativo Huelva | 1:0 | ||||
| 16. Ronde | 02.12.2012 | CD Mirandés | - | CD Guadalajara | 0:0 |  |
|||
| 26. Ronde | 16.02.2013 | CD Guadalajara | - | UD Almería | 2:2 | ||||
| 27. Ronde | 24.02.2013 | Real Madrid Castilla | - | CD Guadalajara | 2:1 |
Spanje