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| U | Leixões SC | - | Vitória Setúbal | 0:1 | ||
| R | Vitória Setúbal | - | Leixões SC | 1:1 | ||
| U: 08.09.2012 18:00 | R: 19.09.2012 19:00 | Winnaars: Vitória Setúbal | ||||
| U | Sporting Covilhã | - | Académica de Coimbra | 2:0 | ||
| R | Académica de Coimbra | - | Sporting Covilhã | 3:2 d.p. | ||
| U: 08.09.2012 22:00 | R: 14.10.2012 19:00 | Winnaars: Académica de Coimbra | ||||
| U | Naval 1° de Maio | - | Gil Vicente | 1:1 | ||
| R | Gil Vicente | - | Naval 1° de Maio | 1:2 | ||
| U: 09.09.2012 19:00 | R: 13.10.2012 17:00 | Winnaars: Naval 1° de Maio | ||||
| U | União da Madeira | - | GD Estoril | 0:1 | ||
| R | GD Estoril | - | União da Madeira | 1:1 | ||
| U: 13.09.2012 18:00 | R: 31.10.2012 17:00 | Winnaars: GD Estoril | ||||
| U | CD Feirense | - | Moreirense FC | 1:0 | ||
| R | Moreirense FC | - | CD Feirense | 4:2 d.p. | ||
| U: 26.09.2012 16:00 | R: 31.10.2012 17:00 | Winnaars: Moreirense FC | ||||
| U | CD Santa Clara | - | SC Beira-Mar | 0:1 | ||
| R | SC Beira-Mar | - | CD Santa Clara | 2:1 | ||
| U: 26.09.2012 19:00 | R: 31.10.2012 18:00 | Winnaars: SC Beira-Mar | ||||
| U | SC Freamunde | - | Rio Ave FC | 2:3 | ||
| R | Rio Ave FC | - | SC Freamunde | 0:0 | ||
| U: 26.09.2012 21:30 | R: 31.10.2012 19:00 | Winnaars: Rio Ave FC | ||||
| U | CD Aves | - | Paços de Ferreira | 0:1 | ||
| R | Paços de Ferreira | - | CD Aves | 1:0 | ||
| U: 03.10.2012 17:00 | R: 31.10.2012 17:00 | Winnaars: Paços de Ferreira | ||||
