| 2. Ronde | 17.08.2009 | FC St. Pauli II | - | Hallescher FC | 1:1 | ||||
| 6. Ronde | 07.09.2009 | Chemnitzer FC | - | FC St. Pauli II | 4:0 | ||||
| 7. Ronde | 13.09.2009 | FC St. Pauli II | - | VfL Wolfsburg II | 1:0 | ||||
| 1. Ronde | 16.09.2009 | Hannover 96 II | - | FC St. Pauli II | 0:0 | ||||
| 8. Ronde | 19.09.2009 | FC Oberneuland | - | FC St. Pauli II | 0:2 | ||||
| 9. Ronde | 25.09.2009 | FC St. Pauli II | - | TeBe Berlin | 1:1 | ||||
| 10. Ronde | 04.10.2009 | ZFC Meuselwitz | - | FC St. Pauli II | 0:0 | ||||
| 12. Ronde | 25.10.2009 | Hamburger SV II | - | FC St. Pauli II | 4:0 | ||||
| 13. Ronde | 31.10.2009 | FC St. Pauli II | - | Türkiyemspor Berlin | 2:2 | ||||
| 20. Ronde | 14.02.2010 | FC St. Pauli II | - | Goslarer SC | 2:1 | ||||
| 28. Ronde | 11.04.2010 | 1. FC Magdeburg | - | FC St. Pauli II | 1:0 | ||||
| 23. Ronde | 14.04.2010 | FC St. Pauli II | - | Chemnitzer FC | 3:1 | ||||
| 29. Ronde | 17.04.2010 | FC St. Pauli II | - | Hamburger SV II | 0:3 | ||||
| 24. Ronde | 21.04.2010 | VfL Wolfsburg II | - | FC St. Pauli II | 3:0 | ||||
| 30. Ronde | 25.04.2010 | Türkiyemspor Berlin | - | FC St. Pauli II | 3:3 | ||||
| 22. Ronde | 28.04.2010 | Hertha BSC II | - | FC St. Pauli II | 3:0 | ||||
| 31. Ronde | 02.05.2010 | FC St. Pauli II | - | Hansa Rostock II | 1:2 |
Duitsland