| 4. Ronde | 14.09.2008 | Arminia Bielefeld [A-jun] | - | MSV Duisburg [A-jun] | 1:3 | ||||
| 5. Ronde | 28.09.2008 | MSV Duisburg [A-jun] | - | Wuppertaler SV [A-jun] | 2:2 | ||||
| 7. Ronde | 26.10.2008 | FC Schalke 04 [A-jun] | - | MSV Duisburg [A-jun] | 1:1 | ||||
| 9. Ronde | 09.11.2008 | Rot-Weiss Essen [A-jun] | - | MSV Duisburg [A-jun] | 2:3 | ||||
| 10. Ronde | 15.11.2008 | MSV Duisburg [A-jun] | - | SG Wattenscheid 09 [A-jun] | 2:1 | ||||
| 13. Ronde | 13.12.2008 | SV Bergisch Gladbach 09 [A-jun] | - | MSV Duisburg [A-jun] | 2:3 | ||||
| 14. Ronde | 14.02.2009 | Borussia Dortmund [A-jun] | - | MSV Duisburg [A-jun] | 1:0 | ||||
| 15. Ronde | 22.02.2009 | MSV Duisburg [A-jun] | - | Alemannia Aachen [A-jun] | 2:2 | ||||
| 17. Ronde | 08.03.2009 | MSV Duisburg [A-jun] | - | Arminia Bielefeld [A-jun] | 1:1 | ||||
| 18. Ronde | 15.03.2009 | Wuppertaler SV [A-jun] | - | MSV Duisburg [A-jun] | 1:4 | ||||
| 19. Ronde | 22.03.2009 | MSV Duisburg [A-jun] | - | Bayer Leverkusen [A-jun] | 2:2 | ||||
| 25. Ronde | 07.06.2009 | 1. FC Köln [A-jun] | - | MSV Duisburg [A-jun] | 2:3 | ||||
| 26. Ronde | 14.06.2009 | MSV Duisburg [A-jun] | - | SV Bergisch Gladbach 09 [A-jun] | 3:4 |
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