| 1. Ronde | 23.07.1988 | FC 08 Homburg | - | Fortuna Köln | 2:0 | ||||
| 3. Ronde | 13.08.1988 | 1. FSV Mainz 05 | - | Fortuna Köln | 2:2 | ||||
| 4. Ronde | 20.08.1988 | Fortuna Köln | - | SpVgg Bayreuth | 3:1 | ||||
| 5. Ronde | 27.08.1988 | SG Wattenscheid 09 | - | Fortuna Köln | 1:3 | ||||
| 7. Ronde | 10.09.1988 | SC Freiburg | - | Fortuna Köln | 2:1 | ||||
| 9. Ronde | 17.09.1988 | Blau-Weiß 90 Berlin | - | Fortuna Köln | 2:1 | ||||
| 10. Ronde | 20.09.1988 | Fortuna Köln | - | FC Schalke 04 | 1:2 | ||||
| 14. Ronde | 29.10.1988 | Fortuna Köln | - | Rot-Weiss Essen | 3:0 | ||||
| 19. Ronde | 14.02.1989 | Hertha BSC | - | Fortuna Köln | 3:0 | ||||
| 31. Ronde | 27.04.1989 | Alemannia Aachen | - | Fortuna Köln | 3:1 | ||||
| 32. Ronde | 01.05.1989 | Fortuna Köln | - | Eintracht Braunschweig | 3:2 |  |
 |
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| 33. Ronde | 13.05.1989 | Rot-Weiss Essen | - | Fortuna Köln | 3:4 | ||||
| 34. Ronde | 20.05.1989 | Fortuna Köln | - | Viktoria Aschaffenburg | 2:0 | ||||
| 35. Ronde | 27.05.1989 | SV Darmstadt 98 | - | Fortuna Köln | 2:1 | ||||
| 36. Ronde | 03.06.1989 | Fortuna Köln | - | VfL Osnabrück | 1:3 | ||||
| 38. Ronde | 18.06.1989 | Fortuna Köln | - | Hertha BSC | 1:0 |
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