| 3. Ronde | 28.08.2016 | VfL Wolfsburg [B-jun] | - | RB Leipzig [B-jun] | 6:5 | ||||
| 4. Ronde | 04.09.2016 | Dynamo Dresden [B-jun] | - | VfL Wolfsburg [B-jun] | 2:3 |  |
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| 5. Ronde | 17.09.2016 | VfL Wolfsburg [B-jun] | - | FC St. Pauli [B-jun] | 3:2 | ||||
| 7. Ronde | 09.10.2016 | Holstein Kiel [B-jun] | - | VfL Wolfsburg [B-jun] | 2:0 | |
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| 9. Ronde | 23.10.2016 | Hamburger SV [B-jun] | - | VfL Wolfsburg [B-jun] | 2:2 | ||||
| 10. Ronde | 30.10.2016 | VfL Wolfsburg [B-jun] | - | Hansa Rostock [B-jun] | 7:0 | ||||
| 11. Ronde | 05.11.2016 | Eintracht Braunschweig [B-jun] | - | VfL Wolfsburg [B-jun] | 0:0 | |
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| 12. Ronde | 12.11.2016 | VfL Wolfsburg [B-jun] | - | TeBe Berlin [B-jun] | 2:1 | ||||
| 16. Ronde | 17.12.2016 | RB Leipzig [B-jun] | - | VfL Wolfsburg [B-jun] | 1:1 | ||||
| 17. Ronde | 19.02.2017 | VfL Wolfsburg [B-jun] | - | Dynamo Dresden [B-jun] | 1:1 | ||||
| 19. Ronde | 05.03.2017 | VfL Wolfsburg [B-jun] | - | Niendorfer TSV [B-jun] | 12:0 | ||||
| 20. Ronde | 12.03.2017 | VfL Wolfsburg [B-jun] | - | Holstein Kiel [B-jun] | 4:2 | ||||
| 21. Ronde | 18.03.2017 | 1. FC Union Berlin [B-jun] | - | VfL Wolfsburg [B-jun] | 1:4 | ||||
| 22. Ronde | 02.04.2017 | VfL Wolfsburg [B-jun] | - | Hamburger SV [B-jun] | 2:0 | |
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