| 2. Ronde | 09.08.2006 | SV Wilhelmshaven | - | Hertha BSC II | 0:1 |  |
|||
| 5. Ronde | 25.08.2006 | SV Wilhelmshaven | - | Bayer Leverkusen II | 2:1 | ||||
| 13. Ronde | 28.10.2006 | SV Wilhelmshaven | - | Fortuna Düsseldorf | 1:1 | ||||
| 14. Ronde | 04.11.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | SV Wilhelmshaven | 1:0 | ||||
| 16. Ronde | 11.11.2006 | 1. FC Magdeburg | - | SV Wilhelmshaven | 3:0 | ||||
| 17. Ronde | 18.11.2006 | SV Wilhelmshaven | - | Wuppertaler SV | 2:1 | |
|||
| 19. Ronde | 02.12.2006 | SV Wilhelmshaven | - | VfB Lübeck | 1:3 | ||||
| 31. Ronde | 13.04.2007 | SV Wilhelmshaven | - | VfL Osnabrück | 1:0 | ||||
| 32. Ronde | 21.04.2007 | Fortuna Düsseldorf | - | SV Wilhelmshaven | 1:1 | ||||
| 33. Ronde | 28.04.2007 | SV Wilhelmshaven | - | Rot-Weiß Erfurt | 3:5 | ||||
| 34. Ronde | 05.05.2007 | Dynamo Dresden | - | SV Wilhelmshaven | 3:1 | ||||
| 35. Ronde | 12.05.2007 | SV Wilhelmshaven | - | 1. FC Magdeburg | 0:2 | ||||
| 36. Ronde | 19.05.2007 | Wuppertaler SV | - | SV Wilhelmshaven | 5:2 | |
|||
| 37. Ronde | 26.05.2007 | SV Wilhelmshaven | - | Borussia Dortmund II | 0:2 | ||||
| 38. Ronde | 02.06.2007 | VfB Lübeck | - | SV Wilhelmshaven | 6:0 |
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