| 8. Ronde | 18.08.2012 | FC Ingolstadt 04 II | - | FC Ismaning | 2:2 | ||||
| 11. Ronde | 08.09.2012 | FC Ismaning | - | TSV Buchbach | 0:0 | ||||
| 12. Ronde | 15.09.2012 | VfL Frohnlach | - | FC Ismaning | 2:2 | ||||
| 13. Ronde | 22.09.2012 | FC Ismaning | - | Eintracht Bamberg | 0:1 | ||||
| 27. Ronde | 09.03.2013 | FC Ismaning | - | FC Ingolstadt 04 II | 0:2 | ||||
| 28. Ronde | 16.03.2013 | TSV 1860 Rosenheim | - | FC Ismaning | 1:0 | ||||
| 29. Ronde | 23.03.2013 | FC Ismaning | - | 1. FC Nürnberg II | 0:2 | ||||
| 30. Ronde | 30.03.2013 | TSV Buchbach | - | FC Ismaning | 1:1 | ||||
| 31. Ronde | 07.04.2013 | FC Ismaning | - | VfL Frohnlach | 1:2 | ||||
| 32. Ronde | 13.04.2013 | Eintracht Bamberg | - | FC Ismaning | 3:0 | ||||
| 34. Ronde | 27.04.2013 | FC Ismaning | - | FV Illertissen | 0:1 | ||||
| 38. Ronde | 25.05.2013 | FC Ismaning | - | SV Seligenporten | 3:1 |
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