| 4. Ronde | 11.08.2006 | SpVgg Weiden | - | SpVgg Bayreuth | 0:0 | ||||
| 5. Ronde | 15.08.2006 | VfL Frohnlach | - | SpVgg Weiden | 1:3 |  |
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| 6. Ronde | 19.08.2006 | SpVgg Weiden | - | SC Fürstenfeldbruck | 1:1 | |
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| 7. Ronde | 25.08.2006 | Jahn Regensburg | - | SpVgg Weiden | 3:0 | ||||
| 8. Ronde | 30.08.2006 | SpVgg Weiden | - | Wacker Burghausen II | 2:1 | ||||
| 9. Ronde | 02.09.2006 | SpVgg Bayern Hof | - | SpVgg Weiden | 2:0 | ||||
| 10. Ronde | 09.09.2006 | SpVgg Weiden | - | SpVgg Unterhaching II | 1:0 | ||||
| 11. Ronde | 16.09.2006 | SpVgg Greuther Fürth II | - | SpVgg Weiden | 2:0 | ||||
| 20. Ronde | 18.11.2006 | SpVgg Weiden | - | Würzburger FV | 2:0 | ||||
| 21. Ronde | 26.11.2006 | 1. FC Nürnberg II | - | SpVgg Weiden | 3:0 | |
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| 22. Ronde | 02.12.2006 | SpVgg Weiden | - | FC Ismaning | 1:2 | ||||
| 23. Ronde | 09.12.2006 | SpVgg Bayreuth | - | SpVgg Weiden | 2:2 | ||||
| 24. Ronde | 24.02.2007 | SpVgg Weiden | - | VfL Frohnlach | 2:0 | |
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| 25. Ronde | 04.03.2007 | SC Fürstenfeldbruck | - | SpVgg Weiden | 0:2 | ||||
| 26. Ronde | 09.03.2007 | SpVgg Weiden | - | Jahn Regensburg | 0:0 | |
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| 27. Ronde | 17.03.2007 | Wacker Burghausen II | - | SpVgg Weiden | 0:1 | |
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| 29. Ronde | 31.03.2007 | SpVgg Unterhaching II | - | SpVgg Weiden | 2:1 | |
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