| 1. Ronde | 20.07.2013 | Preußen Münster | - | Wacker Burghausen | 3:0 |  |
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| 2. Ronde | 27.07.2013 | Wacker Burghausen | - | MSV Duisburg | 0:2 | |
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| 3. Ronde | 10.08.2013 | Wacker Burghausen | - | RB Leipzig | 1:2 | ||||
| 4. Ronde | 17.08.2013 | Rot-Weiß Erfurt | - | Wacker Burghausen | 1:1 | ||||
| 5. Ronde | 24.08.2013 | Wacker Burghausen | - | SV Wehen Wiesbaden | 1:3 | ||||
| 6. Ronde | 31.08.2013 | Holstein Kiel | - | Wacker Burghausen | 2:1 | |
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| 7. Ronde | 04.09.2013 | Wacker Burghausen | - | SV 07 Elversberg | 0:1 | ||||
| 8. Ronde | 08.09.2013 | VfB Stuttgart II | - | Wacker Burghausen | 4:0 | ||||
| 10. Ronde | 22.09.2013 | SpVgg Unterhaching | - | Wacker Burghausen | 1:3 | |
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| 11. Ronde | 28.09.2013 | Wacker Burghausen | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 2:2 | |
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