| 1. Ronde | 05.08.2006 | 1. FC Magdeburg | - | Hamburger SV II | 0:0 | ||||
| 2. Ronde | 09.08.2006 | Hamburger SV II | - | Wuppertaler SV | 1:4 | ||||
| 3. Ronde | 13.08.2006 | Borussia Dortmund II | - | Hamburger SV II | 1:2 | ||||
| 4. Ronde | 20.08.2006 | Hamburger SV II | - | VfB Lübeck | 1:0 | ||||
| 5. Ronde | 26.08.2006 | Werder Bremen II | - | Hamburger SV II | 3:1 | ||||
| 6. Ronde | 02.09.2006 | Hamburger SV II | - | Hertha BSC II | 4:1 | ||||
| 7. Ronde | 09.09.2006 | 1. FC Union Berlin | - | Hamburger SV II | 0:1 | ||||
| 8. Ronde | 16.09.2006 | Hamburger SV II | - | SV Wilhelmshaven | 3:1 | ||||
| 9. Ronde | 23.09.2006 | Bayer Leverkusen II | - | Hamburger SV II | 2:1 |  |
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