| 1. Ronde | 02.08.2003 | Preußen Münster | - | FC Schalke 04 II | 1:3 | ||||
| 6. Ronde | 07.09.2003 | FC Schalke 04 II | - | VfR Neumünster | 1:1 | ||||
| 7. Ronde | 13.09.2003 | KFC Uerdingen 05 | - | FC Schalke 04 II | 4:1 | ||||
| 8. Ronde | 21.09.2003 | FC Schalke 04 II | - | Eintracht Braunschweig | 3:1 |  |
|||
| 9. Ronde | 27.09.2003 | SG Wattenscheid 09 | - | FC Schalke 04 II | 1:4 | ||||
| 16. Ronde | 16.11.2003 | FC Schalke 04 II | - | Chemnitzer FC | 2:0 | ||||
| 19. Ronde | 10.12.2003 | Borussia Dortmund II | - | FC Schalke 04 II | 5:0 | ||||
| 18. Ronde | 21.02.2004 | FC Schalke 04 II | - | Preußen Münster | 0:2 | ||||
| 21. Ronde | 08.03.2004 | 1. FC Köln II | - | FC Schalke 04 II | 1:2 | |
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| 20. Ronde | 30.03.2004 | FC Schalke 04 II | - | Sachsen Leipzig | 1:1 |  |
|||
| 32. Ronde | 22.05.2004 | FC Schalke 04 II | - | Rot-Weiss Essen | 0:7 | |
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