| 1. Ronde | 26.07.2008 | Wacker Burghausen | - | Stuttgarter Kickers | 2:0 | ||||
| 3. Ronde | 16.08.2008 | Wacker Burghausen | - | Fortuna Düsseldorf | 0:4 | ||||
| 6. Ronde | 13.09.2008 | Wuppertaler SV | - | Wacker Burghausen | 2:4 | ||||
| 9. Ronde | 04.10.2008 | Wacker Burghausen | - | Jahn Regensburg | 0:1 | ||||
| 10. Ronde | 18.10.2008 | Eintracht Braunschweig | - | Wacker Burghausen | 2:0 | ||||
| 11. Ronde | 25.10.2008 | Wacker Burghausen | - | Erzgebirge Aue | 0:4 | ||||
| 20. Ronde | 20.12.2008 | Stuttgarter Kickers | - | Wacker Burghausen | 0:0 | ||||
| 19. Ronde | 04.03.2009 | VfB Stuttgart II | - | Wacker Burghausen | 3:0 | ||||
| 21. Ronde | 10.03.2009 | Wacker Burghausen | - | Kickers Offenbach | 0:0 | ||||
| 23. Ronde | 18.03.2009 | Wacker Burghausen | - | 1. FC Union Berlin | 0:0 | ||||
| 27. Ronde | 22.03.2009 | Wacker Burghausen | - | Dynamo Dresden | 0:3 | ||||
| 28. Ronde | 28.03.2009 | Jahn Regensburg | - | Wacker Burghausen | 1:0 | ||||
| 30. Ronde | 04.04.2009 | Erzgebirge Aue | - | Wacker Burghausen | 2:0 |  |
|||
| 35. Ronde | 08.05.2009 | Wacker Burghausen | - | Werder Bremen II | 2:2 |
Duitsland